Page 21 - Chicago

ДНк Детективы ищут СлеДы вируСов Возможно, вы уже слышали про ген- почву для полного пересмотра работы ное картирование, проводимое для санитарно-гигиенических лабораторий, диагностирования редких заболеваний, занимающихся вопросом безопасности предсказаний заболевания раком и со- продуктов питания, и позволит исполь- НовоСтИ медИЦИНЫ ставления родословной. но знали ли вы, зовать эту технологию при работе с эпи- что с его помощью можно выявлять пи- демиями других видов. щевые отравления? «Геномная последовательность – это американские Днк детективу начи- на самом деле совершенный метод нают программу в попытке предвос- снятия Днк отпечатков», - говорит Лэнс хитить вспышки эпидемий, в рабочем Прайс, микробиолог из университета порядке расшифровывая Днк потенци- Джорджа Вашингтона, использующий ально смертельных бактерий и вирусов. этот метод для изучения распростране- Первоначальной целью стала листерия, ния устойчивых к антибиотикам бакте- одна из трех самых распространенных рий. Он также считает, что действия CDC причин смерти от пищевого отравле- сильно запоздали. ния. Эти бактерии особенно опасны Особенно в случаях болезней, распро- для беременных женщин. Уже сейчас страняющихся через пищеварительный правительство признает, что технология тракт, данная технология повысит воз- помогла положить конец вспышке эпи- можности исследователей определить демии листерии, во время которой один ответственную за начало заболевания человек погиб в калифорнии и еще 7 за- бактерию. и чем быстрее это произой- болели в мэриленде. дет, тем меньше человек заболеет. «Это на самом деле новый способ об- «Это изменить все, вплоть до установ- наружения и борьбы с инфекциями, ления источника, - добавил Прайс. – От- - сказал доктор Том Фриден, директор зывы продукции стоят очень дорого, Центра по контролю за заболеваниями компании их не любят», и они должны и профилактике. – можно даже задаться быть точными. вопросом, определяет ли он подозре- сегодняшние стандартные тесты ино- ваемого в ходе визуального опознания гда упускают взаимосвязь между боль- или по отпечаткам пальцев?» ными или выводят на ложный след. на- Полная геномная последовательность, пример, американские официальные или картирование всей последователь- лица в 2012 году изначально считали, ности Днк организма, стала главным эле- что эпидемия сальмонеллы в нидер- ментом медицинских исследований. но в ландах, связанная с копченым лососем, области общественного здравоохране- имела какую-то связь с местными боль- ния ее используют более выборочно для ными. Проведенная позже геномная определения особенно опасных очагов последовательность показала, что воз- или возникающих патогенов, таких как будители были разными. новый штамм птичьего гриппа. «нынешний способ субтипирования При повседневном определении оча- сальмонеллы не так уж и хорош», - счи- гов заражения официальные лица по- тает эпидемиолог Дэвид Боксруд из лагаются на применяемые десятилетия- департамента здравоохранения мин- ми тесты, в ходе которых используются несоты, который является частью сети только части Днк. Управления по контролю за продуктами Теперь, когда геномная последова- и лекарствами, начавшего устанавли- тельность становится быстрее и дешев- вать Днк последовательность этой бак- ле, CDC получил $30 млн от конгресса на терии и определять другие по мере их расширение использования этого мето- обнаружения в пище. В эту сеть входят да в программе, получившей название также лаборатории в аризоне, Флори- продвинутое молекулярное обнаруже- де, мэриленде, нью-Йорке, Вирджинии ние. медики надеются, что теперь они и Вашингтоне. смогут быстрее ликвидировать очаги Установление геномной последова- заражения (как распространяемые че- тельности может помочь выявить устой- рез пищевой тракт, так и другие), и, воз- чивость к лекарственным средствам можно, также предупреждать инфекци- и степень вирулентности микроба бы- онные заболевания, лучше поняв, как стрее, чем сегодняшние тесты. Оно так- они распространяются. же помогает установить способ распро- «Честно говоря, в области обществен- странения вируса при помощи мелких ного здравоохранения нам необходимо генетических изменений, которые мож- наверстать упущенное», - сказал доктор но назвать следами. кристофер Брейден из CDC, один из ру- ключевым элементом, позволяющим ководителей проекта. установить «злоумышленника», является Впервые эта технология используется вычислительная способность огромной № 14 [893] 04.11.2014 - 04.17.2014 для наблюдения за обычными заболева- федеральной базы данных, в которой ниями, выявляя пациентов со схожими хранятся генные карты. Одно дело про- штаммами, которые могли заразиться анализировать Днк бактерий, собранное от одного источника. у нескольких десятков пациентов во вре- Если пилотный проект окажется удач- мя эпидемии, и совсем другое – сравнить ным, в CDC считают, что он подготовит образцы, собранные у нескольких тысяч. 21